本部直接投資事業原有中國鋼鐵公司、台灣肥料公司、台鹽實業公司、中華紙漿公司、華擎機械公司、聯華電子公司、台灣工礦公司、等7家，其中聯華電子公司、華擎機械公司係為促進我國IC半導體工業及汽車引擎工業之發展，將科技專案計畫之成果，以技術作價方式轉投資而來；中國鋼鐵公司、台灣肥料公司及台鹽實業公司原為本部所屬國營事業，分別於八十四年、八十八年及九十二年移轉民營；另中華紙漿、台灣工礦二家公司原係台灣省政府所持股權，於精省後自八十九年五月起由本部接管股權。
經濟部直接投資事業94年3月1日起移交財政部統一管理，財政部復於95年9月21日將中國鋼鐵公司、台鹽實業公司、中華紙漿公司及華擎機械公司等4家公司股權移回本部接管，另唐榮公司95年7月5日移轉民營，中華紙漿公司97年3月25日完成釋股，台灣造船公司97年12月18日移轉民營，故本部直接投資事業計有中鋼等5家公司。