企劃審議組
*研議規劃本部及所屬資訊願景、目標、策略與計畫
*研議推動本部及所屬資訊法規、作業流程、資訊治理機制
*研訂資訊人力發展藍圖、人員進用、考績及派駐管理作業
*規劃辦理資訊教育訓練與推廣作業
*跨機關資訊業務之綜合規劃、協調、查核、審議、追蹤、控管及行政院電子化政府計畫業務統籌作業
*本部及所屬資訊預算之審查及控管
*行政資訊系統操作及使用
*辦理監管之財團法人業務督導、績效查核
*使用者滿意度調查作業
*辦理採購法相關業務
制度工程組
*行政資訊系統規劃、開發及維運(包括中英文全球資訊網、投資台灣入口網、經濟地理資訊系統、公文相關資訊系統、部內服務網站、OA系統及相關行政系統等)
*業務資訊系統規劃、開發及維運(包括部本部各單位、經貿培訓所業務資訊系統及國土資訊系統)
*評估及引進應用軟體開發輔助工具
*辦理行政院電子化服務平台應用業務
*行政院電子化政府計畫執行作業
*本部各幕僚單位資訊業務窗口
系統管理組
*辦理本部資通安全處理小組業務
*擬訂及推動本部及所屬本部資訊安全政策與制度
*推動資訊安全管理制度(ISMS)管理制度
*規劃及維運本部資安防護及監控機制
*規劃及維運本部及所屬機關共享資訊安全服務
*規劃推動及維運電子檔案加密保護機制
*辦理本部個人資料保護推動執行小組之技術分組業務
*行政院電子化政府計畫執行作業
*駐外機構資訊安全業務
資訊服務組
*網路基礎架構管理
*電子郵件系統管理
*資料備份系統管理
*作業平台及主機管理(含Windows/Unix/Linux/虛擬主機等)
*資料庫管理（含MSSQL、MYSQL、Oracle等）
*機房管理
*身分認證系統管理(單一簽入/智慧卡/動態密碼鎖/SSL伺服器憑證等)
*SAN 基礎架構維運管理
*電腦報修熱線服務
*個人電腦軟、硬體管理
*使用者終端設備軟硬體操作使用教育訓練
*規劃及維運視訊系統作業
*應用系統版本控管及程式版更作業
*辦理駐外機關資通基礎設施相關業務