1、人民對於本部所屬行政機關（如工業局、國際貿易局、智慧財產局、標準檢驗局、水利署等）所為之行政處分，認為違法或不當，致損害其權利或利益者，所提起之訴願案。（訴願法第4條第6款）
2、人民對於各縣（市）政府、直轄市政府，處理屬於本部主管監督範圍之事項（如違反商業登記法、電子遊戲場業管理條例等事件）所為之行政處分，認為違法或不當，致損害其權利或利益者，所提起之訴願案。（訴願法第4條第3、5款）
3、人民因前述本部所屬行政機關，各縣（市）政府及直轄市政府處理屬於本部主管監督範圍之事項，對其依法申請之案件，於法定期間內應作為而不作為，認為損害其權利或利益者，所提起之訴願案。（訴願法第2條第1項）